Lohjan Karnainen mainitaan ensimmäisen kerran vuonna 1401 (FMU 1189). Kylässä oli tuolloin ainakin neljä tilaa. Vuonna 1540 tiloja oli yhdeksän. Karnaisten vanhin kartta on vuodelta 1699 (KA MH B25 15/1). Kartalle on merkitty kaksi erillistä tonttimaata. Niistä eteläisempi on kruunulle peruutettu säteri.
Karnaisten keskiaikainen kylätontti sijaitsee Karnaisten Setolan-Rakuunannummen alueella sekä peltoaukean eteläpuolella Koivulan alueella. Ensimmäinen maininta on vuodelta 1404. Vt-1 inventoinnissa 2002 tarkastettiin Kisakalliontien itäpuolista aluetta aution Setolan talon tontilla. Kisakalliontien itäpuolella on aivan tien vieressä kivijalka ja muitakin heinikon peittämiä kivirakenteita. V. 2003 Vt-1 linjauksen koekaivausten yhteydessä kaivettiin Setolan itärinteessä keskiaikaista tiilenpolttopaikkaa ym. historiallisen ajan jäännöksiä. Vuonna 2004 tarkastettiin metsäalue Kisakalliontien länsipuolella. Tien länsipuolella olevian talojen eteläpuolella on avointa metsää ja niittyä, jossa on erilaisia rakennusten jäänteitä, mm. vanhan navetan betonijalka. Alueella on myös vanhemmilta vaikuttavia kivikumpuja ja kuoppia. Osa saattaa olla liesikumpuja. Näissä oli myös tiiliä havaittavissa. Alarinteessä, pellon reunassa on vanha tienpohja, joka on ajoittain näkyvissä ja ilmeisesti osin pelloksi muokattu. Vanhan tien reunassa pellon penkereellä kasva paikoin tummaa tulikukkaa. Tie lienee vanha Karnaisten kylätie, jonka linjaus on piirrettynä 1700-luvun isojakokarttoihin.
Vuonna 2016 tehdyssä Karnaisten asemakaavan inventoinnissa todettiin muinaisjäännöksen jatkuvan vielä tutkimusalueen luoteisnurkkaan. Inventoinnin perusteella muinasjäännöksen rajausta on muutettu.
Luonti: 28.4.2005 Viimeisin muutos: 5.12.2017
Tutkimukset
Petro Pesonen tarkastus 2004
Löydöt: -
Huomautuksia: Lohjan Hossanmäen asuinpaikkakaivauksen yhteydessä tehty tarkastus. Raportti jätetty 6.4.2005.
Luonti: 28.4.2005 Viimeisin muutos: 28.4.2005
Petro Pesonen koekaivaus 2003
Löydöt: KM 2003120:1-29 ?
Huomautuksia: Kaivausraportti Museoviraston rakennushistorian osaston arkistossa
Luonti: 28.4.2005 Viimeisin muutos: 28.4.2005
Petro Pesonen inventointi 2002
Luonti: 14.10.2005
V.-P. Suhonen arkistotutkimus 2010
Huomautuksia: Espoo-Salo -oikorata, Linjausvaihtoehtojen Lohja-Salo arkisto- ja karttaselvitykset 2010.
Luonti: 29.4.2010
Ville Laakso ja Timo Sepänmaa inventointi 2016
Huomautuksia: Lohja Karnainen asemakaavan ja asemakaavan muutosalueen muinaisjäännösinventointi 2016
Luonti: 5.12.2017 Viimeisin muutos: 5.12.2017
Ladattava tiedosto saattaa sisältääkuvia, karttoja tai muita sisältöjäjotka ovat tekijänoikeuksin suojattuja. Tiedoston tekijänoikeudet kuuluvat tutkimusraportin tekijälle ja muille raportissa mainituille tahoille. Sisällön jatkokäyttöävarten on hankittava lupa tekijänoikeuksien haltijalta.